Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PUM3Q15397 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PUM3Q15397 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms