Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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