Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTCH1Q13635 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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