Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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IFT88Q13099 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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IFT88Q13099 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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IFT88Q13099 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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IFT88Q13099 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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IFT88Q13099 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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IFT88Q13099 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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