Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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TRAF1Q13077 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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TRAF1Q13077 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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TRAF1Q13077 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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