Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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PGGT1BP53609 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PGGT1BP53609 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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