Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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CASQ1P31415 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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CASQ1P31415 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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CASQ1P31415 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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CASQ1P31415 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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CASQ1P31415 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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CASQ1P31415 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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CASQ1P31415 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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CASQ1P31415 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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CASQ1P31415 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
CASQ1P31415 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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