Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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