Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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