Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms