Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms