Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CTXN3Q4LDR2 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms