Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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CCDC27Q2M243 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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CCDC27Q2M243 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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CCDC27Q2M243 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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CCDC27Q2M243 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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CCDC27Q2M243 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CCDC27Q2M243 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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