Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SYCP1Q15431 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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