Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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SF3B2Q13435 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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SF3B2Q13435 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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