Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 SMIM7-201ENST00000358726 850 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 FCAR-206ENST00000391724 762 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 CNN2P7-201ENST00000400583 932 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RNA5SP221-201ENST00000411271 103 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC099560.1-201ENST00000412811 500 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 SNAI1P1-201ENST00000428587 777 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 GNGT2-205ENST00000511673 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC018653.2-201ENST00000540190 238 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 TMEM106C-212ENST00000549288 321 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ASTE1-201ENST00000264992 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 MIAT-218ENST00000613780 10143 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 BCLAF3-203ENST00000379687 6528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC005863.1-201ENST00000379640 2998 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 CASP7-207ENST00000452490 2271 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 NUCB2-208ENST00000529010 2274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 BACE1-202ENST00000392937 5155 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 NSD2-207ENST00000398261 8390 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 PPFIBP1-207ENST00000537927 5719 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 FAM193A-203ENST00000502458 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ADGRF1-201ENST00000283297 2142 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 TMEM87A-202ENST00000389834 3109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 STON2-201ENST00000267540 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 KIAA0040-201ENST00000423313 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AL356019.2-201ENST00000556738 3829 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ELP3-202ENST00000380353 3078 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 SPATA31A6-201ENST00000332857 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 UACA-203ENST00000539319 4026 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC100756.3-201ENST00000618455 1816 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC084880.1-201ENST00000392530 545 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AL353754.1-201ENST00000440219 340 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AL353194.1-201ENST00000451507 441 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 GSTO3P-201ENST00000504733 718 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC106774.1-201ENST00000515105 321 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC011676.1-201ENST00000517658 397 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AP004245.1-201ENST00000530434 259 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC099684.3-201ENST00000574483 560 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RPL10P15-201ENST00000585756 315 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC026150.3-201ENST00000602595 499 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 NOLC1-209ENST00000605788 3932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 PIGK-201ENST00000359130 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ABLIM1-205ENST00000369266 2230 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 TFIP11-217ENST00000619735 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC091152.4-201ENST00000623480 3483 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ITIH2-201ENST00000358415 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ZNF23-202ENST00000358700 2692 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ZBTB40-202ENST00000375647 8685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 SERPIND1-201ENST00000215727 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 CSMD2-205ENST00000373381 13698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RBBP5-202ENST00000367164 4290 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 MIR425-201ENST00000362162 87 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 AC116050.1-206ENST00000423774 213 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
CACNB1Q02641 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms