Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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HOXD10P28358 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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