Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 LINC00964-202ENST00000510897 3534 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 PDE1A-201ENST00000351439 2338 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 CEBPG-202ENST00000585933 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC006141.1-201ENST00000581917 2170 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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HOXA2O43364 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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HOXA2O43364 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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HOXA2O43364 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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