Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC1Q9Y5R8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms