Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD2APQ9Y5K6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD2APQ9Y5K6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms