Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
THRAP3Q9Y2W1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
THRAP3Q9Y2W1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms