Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LEMD3Q9Y2U8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LEMD3Q9Y2U8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LEMD3Q9Y2U8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LEMD3Q9Y2U8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LEMD3Q9Y2U8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LEMD3Q9Y2U8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LEMD3Q9Y2U8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LEMD3Q9Y2U8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LEMD3Q9Y2U8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LEMD3Q9Y2U8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LEMD3Q9Y2U8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LEMD3Q9Y2U8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LEMD3Q9Y2U8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms