Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NOD1Q9Y239 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NOD1Q9Y239 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms