Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGSF9BQ9UPX0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms