Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNX12Q9UMY4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms