Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ALKQ9UM73 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ALKQ9UM73 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALKQ9UM73 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ALKQ9UM73 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ALKQ9UM73 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ALKQ9UM73 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ALKQ9UM73 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALKQ9UM73 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALKQ9UM73 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ALKQ9UM73 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ALKQ9UM73 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALKQ9UM73 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALKQ9UM73 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ALKQ9UM73 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ALKQ9UM73 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ALKQ9UM73 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ALKQ9UM73 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ALKQ9UM73 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ALKQ9UM73 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ALKQ9UM73 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALKQ9UM73 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALKQ9UM73 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ALKQ9UM73 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ALKQ9UM73 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ALKQ9UM73 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ALKQ9UM73 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ALKQ9UM73 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALKQ9UM73 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALKQ9UM73 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALKQ9UM73 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ALKQ9UM73 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ALKQ9UM73 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ALKQ9UM73 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ALKQ9UM73 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ALKQ9UM73 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ALKQ9UM73 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALKQ9UM73 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALKQ9UM73 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ALKQ9UM73 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ALKQ9UM73 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ALKQ9UM73 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ALKQ9UM73 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ALKQ9UM73 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ALKQ9UM73 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ALKQ9UM73 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALKQ9UM73 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ALKQ9UM73 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALKQ9UM73 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ALKQ9UM73 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ALKQ9UM73 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ALKQ9UM73 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALKQ9UM73 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALKQ9UM73 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ALKQ9UM73 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALKQ9UM73 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALKQ9UM73 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALKQ9UM73 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ALKQ9UM73 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ALKQ9UM73 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ALKQ9UM73 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ALKQ9UM73 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ALKQ9UM73 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ALKQ9UM73 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.52■■■□□ 2
ALKQ9UM73 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ALKQ9UM73 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms