Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP25Q9UHP3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP25Q9UHP3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms