Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PHRF1Q9P1Y6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms