Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMOD2Q9NZR1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMOD2Q9NZR1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
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