Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK1

TLR7, Toll-like receptor 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,049 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR7Q9NYK1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TLR7Q9NYK1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TLR7Q9NYK1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms