Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GINM1Q9NU53 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GINM1Q9NU53 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms