Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
AKIP1Q9NQ31 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AKIP1Q9NQ31 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms