Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVK-5Q9HDB9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms