Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C11orf49Q9H6J7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms