Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CNTNAP4Q9C0A0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNTNAP4Q9C0A0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms