Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SNHG12Q9BXW3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SNHG12Q9BXW3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms