Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOL6Q9BWW8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOL6Q9BWW8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOL6Q9BWW8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOL6Q9BWW8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOL6Q9BWW8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOL6Q9BWW8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOL6Q9BWW8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOL6Q9BWW8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOL6Q9BWW8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOL6Q9BWW8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOL6Q9BWW8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOL6Q9BWW8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms