Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR3CQ9BUI4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR3CQ9BUI4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms