Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAGR1Q9BTK6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAGR1Q9BTK6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms