Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RETNLBQ9BQ08 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms