Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMTK3Q96Q04 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMTK3Q96Q04 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms