Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRRC7Q96NW7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC7Q96NW7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms