Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRRC1Q96M27 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms