Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC17Q96LX7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms