Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM47Q96LD4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM47Q96LD4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms