Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUNDC1Q96C34 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUNDC1Q96C34 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms