Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRG4Q92954 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRG4Q92954 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms