Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC107Q8WV48 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC107Q8WV48 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms