Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHTF2Q8N3S3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHTF2Q8N3S3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms