Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYCP3Q8IZU3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP3Q8IZU3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms